哈巴河縣位于新疆維吾爾自治區最西北部，阿爾泰山脈中段西部南麓，準噶爾盆地北緣。地處東經85°33＇- 87°09＇，北緯47°38＇- 49°09＇之間，南北長168千米，東西寬90-100千米，面積8180平方公里。西北與哈薩克斯坦、俄羅斯兩國接壤，東鄰布爾津縣，南接吉木乃縣。